营养不良是克罗恩患者普遍有的情况，建议患者每日都要摄入足够的营养补充，并建议在日常三餐之外再添加2-3次辅食或肠内营养。虽然目前尚没有哪个平衡饮食配方得到普遍认可，但总的原则是：少量分次食用平衡饮食。从控制病情活动的角度出发，添加肠内营养比进食普通饮食安全可靠，控制病情的效果更好。
多数克罗恩患者都知道某些特定的食物可能导致病情复发或加重，所以患者应该建立饮食档案，记录哪些食物会加重消化道症状。如果能很好地回避这些“罪犯食物”，某些消化道症状会变得相对容易控制。
对多数患者而言，多吃下列食物可能加重病情，甚至引起复发：
1.烤肉、熏肉、油炸食品(如西式快餐)
2.红肉(牛排等)及带皮的禽肉
3.黄油和其它动物油、人造奶油、面包酱、蛋黄酱等
4.奶制品(如果有乳糖不耐受的情况，则更要注意避免)
5.饮酒(啤酒、白酒、鸡尾酒等)
6.碳酸饮料、咖啡、浓茶、巧克力、爆米花等
7.未成熟的水果及生吃蔬菜(如蔬菜沙拉等)
8.产气食品(扁豆、大豆、卷心菜、花椰菜、洋葱等)
9.含麦麸较多的食品(针对有肠管狭窄等情况)。
10.辛辣食品(麻辣火锅)
其中，对于有肠道狭窄/不全肠梗阻的患者，需要进低渣饮食，避免吃粗粮、玉米饼、坚果、蔬菜等高纤维食品，以免食物残渣过多加重梗阻。此类患者应考虑使用肠内营养。
对于不耐受的食物，如果改变烹饪方法可能会减少这种不耐受性，比如，如果吃蔬菜沙拉会引起腹泻，并不意味着对那种蔬菜不耐受，如果改为吃煮熟的菜，也许不会引起胃肠道症状。假设食用牛肉或猪肉出现脂肪泻，可以改为低脂肪的鱼肉作为主要的蛋白质来源。
一般而言，谷物和以下食物适合克罗恩患者食用：
1.蔬菜(叶菜)
2.高纤食物(土豆等)
3.鱼肉(深海鱼类更好)
4.蛋类(蛋清更好)
5.橄榄油/种子油
6.水果(请削皮)/坚果
7.大米/面食
吸烟会提高克罗恩的发病率
吸烟是克罗恩的独立危险因素，能升高克罗恩的发病率，增加狭窄、肠瘘的可能，增加手术率，抵消维持缓解用药的疗效，被动吸烟者的患病风险更大;吸烟也是术后复发的主要危险因素，吸烟者的术后复发率是不吸烟者的2.5倍，戒烟4年后克罗恩的复发率与不吸烟者相同。所以，克罗恩患者应及早戒烟。
适量的体育锻炼和健康的起居习惯对维持缓解、预防复发有很大帮助。研究表明，低强度运动能减低疾病活动度，增加体重，纠正营养不良，防止骨骼脱钙，提高生活质量。而劳累、熬夜、情感应激、抑郁、焦虑、自闭等精神因素是克罗恩的诱发和加重因素，所以保持积极乐观的心态对控制病情很有好处。
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