很多病人会有这样得疑惑，得了IBD，诊断的时候，花了很长很长时间，做了很多很多检查，最终还没法确诊，或者确诊得过程比较曲折，甚至等到很重得时候才诊断了这个病。
主要有以下几方面原因：
1、患者或医生认知有限；
很多病人一开始有了腹痛、腹泻，往往不是很重视，会当成普通肠炎、阑尾炎，没有及时就诊，有部分病人表现为阑尾炎，开刀切除阑尾，以为就可以了，结果却最终发现是炎症性肠病合并阑尾病变。
炎症性肠病最先发现是在年，相对于其他普通疾病，总体来说，是一个比较年轻的疾病。炎症性肠病以前，比如说30年前，在我们国家是很少见的，医生认知还是有限，医院医生。但是，近10余年，在我们国家发病率呈现急剧增长得趋势，现在这个病已经逐渐进入公众视野，大家对他的认知已经有了相当大的提高。
2、前期发现隐匿，表现多样；
炎症性肠病，疾病前期腹痛往往不是很剧烈，认为不影响生活。而且表现多样，有些首发症状并不是在肠道，而是在肠外，比如关节炎、皮肌炎，此时大家都不知道，要找消化病科医生看，所以难以诊断。
在疾病早期，病变更加不典型，对于某些患者来说，一开始并不能确诊为炎症性肠病，直到一段时间以后，慢性炎症所导致的症状才会渐渐明显起来，比如出现肠道狭窄、肠瘘才给临床医生足够多的证据，提示就是炎症性肠病了。
3、和很多疾病症状相似，难以诊断；
炎症性肠病（克罗恩病和溃疡性结肠炎）的很多症状与其他疾病类似，如细菌、病毒或寄生虫感染也可以引发急性肠炎，服用药物（如抗炎药)也会引发结肠炎的症状，如疼痛、痉挛、腹泻。肠镜对于结肠炎很难做出鉴别诊断，病理结果病变多不典型，病理的作用更多在于排除性诊断，这种情况。
4、无诊断金标准；
最后一点，也是最重要的一点，炎症性肠病不像很多疾病，有诊断金标准，好比，某些感染性疾病，只要我找到了细菌、病毒，就可以确诊，恶性肿瘤，只要我在显微镜下找到癌细胞了，就可以确诊。IBD诊断是没有金标准的，更多的是要排除很多疾病后，根据临床症状，做出临床诊断，特别困难。
正是由于以上原因，给临床医生造成极大的困难，所以需要做的检查比较多，比如胃镜、肠镜、胶囊内镜、核磁共振、CT、病理活检、反复的抽血，对病人及家属心理上，确实会比较煎熬。
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