今天是第期日报。
Science：结肠细胞代谢如何塑造肠道菌群（综述）Science[IF:41.]
①结肠细胞代谢是调控肠道稳态的开关，肠道稳态时结肠细胞代谢趋于氧化磷酸化和脂肪酸氧化，耗氧量高；②由此形成的低氧环境利于专性厌氧菌生长，它们可降解纤维生成短链脂肪酸，进而促进宿主健康；③若结肠细胞代谢状态改变、肠上皮氧合作用增加，会导致以兼性厌氧菌增殖为特征的菌群失调；④肠道病原体会破坏结肠细胞代谢，以逃脱肠道菌群的生态位保护作用；⑤通过代谢重编程恢复结肠细胞缺氧、维护结肠稳态，是治疗多种疾病的潜在策略。
Colonocytemetabolismshapesthegutmicrobiota11-29,doi:10./science.aat
多种慢性疾病可能与肠道菌群失调有关，近期研究表明，结肠上皮细胞的代谢状态对于菌群的塑造有很大影响。Science本周发表的综述对此进行探讨，提出结肠细胞的两种代谢状态（炎症和稳态）类似于巨噬细胞的M1和M2极化，恢复结肠细胞缺氧代谢状态的治疗策略，或能改善肠道菌群失调和相关疾病。（
mildbreeze）曾建国+樊伟+呙于明等：鸡肠道宏基因组与抗生素促生长剂替代物Microbiome[IF:9.]
①首次构建涵盖7个鸡种、全部肠段的鸡肠道宏基因集（万基因），菌群多样性及功能与饲养模式、肠段及日龄有关；②博落回提取物（MCE）作为促生长抗生素的替代品，主要通过影响前肠菌群，降低宿主炎症，促进肉鸡的生长与健康；③金霉素（CTC）和MCE分别促进链霉菌科和乳杆菌属的生长，但CTC会使抗生素合成通路及耐药基因增加，而MCE不会；④二者都增强菌群次级胆汁酸生成能力，CTC还促进脂肪酸合成，而MCE则加强氨基酸与维生素生成途径。
Thechickengutmetagenomeandthemodulatoryeffectsofplant-derivedbenzylisoquinolinealkaloids11-27,doi:10./s---5
动物养殖中常用低剂量抗生素促进动物生长，但会加剧抗生素耐药性问题，威胁人类健康，寻找替代抗生素的促生长剂对养殖业的发展有重要意义。Microbiome近期发表了由湖南农业大学曾建国、中国农业科学院樊伟和呙于明合作主导的研究，首次构建了涵盖所有肠段的鸡肠道微生物参考基因集，分析了博落回提取物（MCE）对肉鸡肠道菌群和生长健康的影响，并与抗生素进行对比，揭示了二者促进肉鸡生长的机制差异，表明MCE作为抗生素促生长剂的替代品在养殖业中的应用潜力。（
mildbreeze）如何解决低微生物量菌群研究的污染问题？TrendsinMicrobiology[IF:11.]
①微生物组研究，尤其是针对低微生物量的样品，可存在污染问题，主要源于非样本DNA和样本间的交叉污染；②RIDE核对清单可帮助研究者、编辑和审稿人科学评价菌群研究中的污染问题；③采样和处理过程中要尽量保持环境与材料的清洁和步骤的统一，严格设置采样、DNA提取和非模板扩增的阴性和阳性对照；④数据分析时可采用如下三种策略减少污染的影响：比较对照与生物样本之间的差异、从生物样本中剔除阴性对照数据、利用模型估测存在的污染。
ContaminationinLowMicrobialBiomassMicrobiomeStudies:IssuesandRe中科白癜风看皮肤病更专业数字化伍德灯